PlantTandemDups - A open-resource community for studying tandem gene duplication in plants

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Note:

represents for chromosome assembly, and

for scaffold/superscaffold assembly.

-- A --
- Actinidia chinensis v1.0
- Aegilops tauschii v4.0
- Aethionema arabicum v1.0
- Alnus glutinosa v1.0
- Amaranthus hypochondriacus v2.1
- Amborella trichopoda v1.0
- Ananas comosus v3.0
- Antirrhinum majus v3.0
- Aquilegia coerulea v3.1
- Arabidopsis lyrata v2.1
- Arabidopsis thaliana TAIR11
- Arachis duranensis v1.0
- Arachis ipaensis v1.0
- Artocarpus camansi v1.1
- Asparagus officinalis v1.1
- Atlantia buxifolia v1.0
- Azolla filiculoides v1.1
-- B --
- Benincasa hispida var.B227 v1
- Beta vulgaris ssp.vulgaris.KWS2320v1.2
- Betula pendula v1.0
- Brachypodium distachyon v3.1
- Brassica juncea v1.5
- Brassica napus v5
- Brassica nigra v1.1
- Brassica oleracea var. capitata cv. 02–12 v1.0
- Brassica oleracea var. oleracea cv. TO1000 v2.1
- Brassica rapa v3.0
-- C --
- Cajanus cajan v5.0
- Calotropis gigantea v2.2
- Camellia sinensis v1.0
- Camelina sativa v2.0
- Capsella bursa-pastoris v1.0
- Capsella rubella v1.0
- Capsicum annuum var.glabriusculum v1.0
- Capsicum annuum var.Zunla-1 v1.0
- Capsicum baccatum v1.2
- Capsicum chinense v1.2
- Cardamine hirsuta v1.0
- Carica papaya v0.4
- Carya cathayensis v1.0
- Carya illinoinensis v1.0
- Cephalotus follicularis v3.0
- Chara braunii v1.0
- Chenopodium quinoa v1.0
- Chlamydomonas reinhardtii v5.6
- Chromochloris zofingiensis v5.2
- Chrysanthemum nankingense v2.0
- Cicer arietinum v1.0
- Citrullus lanatus subsp.vulgaris cv.97103 v2
- Citrullus lanatus subsp.vulgaris cv.Charleston Gray v2
- Citrus clementina v1.0
- Citrus grandis v1.0
- Citrus ichangensis v1.0
- Citrus medica v1.0
- Citrus reticulata v1.0
- Citrus sinensis v1.0
- Citrus unshiu v1.0
- Coffea canephora v1.0
- Cucumis melo v4.0
- Cucumis sativus L.var.sativus cv.9930 v3
- Cucumis sativus var.hardwickii PI183967 v1
- Cucurbita argyrosperma subsp.argyrosperma v1
- Cucurbita maxima var. Rimu v1.1
- Cucurbita moschata var.Rifu v1
- Cucurbita pepo subsp.pepo v4.1
- Cuscuta australis v1.0
- Cuscuta campestris v0.32
-- D --
- Daucus carota v2.0
- Dianthus caryophyllus r1.0
-- E --
- Echinochloa crus-galli v6.0
- Ectocarpus siliculosus v2.0
- Eucommia ulmoides v1.0
- Eutrema salsugineum v1.0
-- F --
- Fagopyrum esculentum r1.0
- Fagopyrum tataricum v2.0
- Faidherbia albida v1.0
- Fragaria ananassa r1.2
- Fragaria vescav v4.0.a1
- Fraxinus excelsior v2.0
-- G --
- Glycine max v1.1
- Glycyrrhiza uralensis v1.0
- Gossypium arboretum v2.0
- Gossypium hirsutum v1.1
- Gossypium raimondii v1.0
-- H --
- Handroanthus impetiginosus v1.0
- Helianthus annuus v1.1
- Hordeum vulgare v1.0
-- I --
- Ipomoea triloba v3.0
- Ipomoea trifida v3.0
-- J --
- Juglans regia v1.0
-- K --
- Kalanchoe fedtschenkoi v1.1
-- L --
- Lablab purpureus v1.0
- Lagenaria siceraria v1.0
- Leavenworthia alabamica v1.0
- Linum usitatissimum v1.0
- Liriodendron chinense v1.0
- Lotus japonucs v3.0
-- M --
- Malus domestica Borkh v3.0
- Manihot esculenta v6.1
- Marchantia polymorpha v1.0
- Medicago truncatula Mt4.0v2
- Musa acuminata v2.0
- Musa balbisiana DH-PKW v1.1
- Musa balbisiana PKW v1
- Musa itinerans v1.0
- Musa schizocarpa v1.0
-- N --
- Nicotiana attenuata v2.0
- Nicotiana benthamiana v0.4.4
- Nicotiana obtusifolia v3.0
-- O --
- Olea europaea var.sylvestris v1.0
- Oropetium thomaeum v1.0
- Oryza barthii v1.42
- Oryza brachyantha v1.4b
- Oryza glaberrima v1.42
- Oryza glumipatula v1.5.42
- Oryza longistaminata v1.0.42
- Oryza meridionalis v1.3.42
- Oryza nivara v1.0.42
- Oryza punctata v1.2.42
- Oryza rufipogon w1943.42
- Oryza sativa L ssp.indica v1.42
- Oryza sativa L ssp.japonica v7.0
- Ostreococcus lucimarinus v1.42
-- P --
- Panax notoginseng v2.0
- Petunia axillaris v1.6.2
- Petunia inflata v1.0.1
- Phaeodactylum tricornutum v1.0
- Phalaenopsis aphrodite v1.0
- Phalaenopsis equestris v1.0
- Phaseolus vulgaris v2.1
- Phoenix dactylifera v2.0
- Physcomitrella patens v3.3
- Picea abies v1.0
- Populus alba v1.0
- Populus euphratica v1.0
- Populus pruinosa v1.0
- Populus tremula v1.0
- Populus tremuloides v1.0
- Populus trichocarpa v3.1
- Porphyra umbilicalis v1.5
- Primula vulgaris v2.0
- Prunus avium v1.0
- Prunus mume v1.0
- Prunus persica v2.0.a1
- Pyrus bretschneideri v1.0
-- Q --
- Quercus lobata v3.0
- Quercus robur vPM1N
-- R --
- Raphanus sativus v1.0
- Rhodiola crenulata v1.0
- Ricinus communis v0.1
- Rosa chinensis var.Old Blush v2.0.a1
- Rosa multiflora v2.0
-- S --
- Saccharum spontaneum v20190103
- Saccharum spp.R570 v1.0
- Salix purpurea v5.1
- Salix suchowensis v1.0
- Salvinia cucullata v1.2
- Sclerocarya birrea v1.0
- Selaginella moellendorffii v1.0
- Sesamum indicum cv.Baizhima v1.0
- Sesamum indicum cv.Mishuozhima v1.0
- Sesamum indicum var.Swetha v1.0
- Sesamum indicum var.Yuzhi11 v1.0
- Sesamum indicum var.Zhongzhi13 v2.0
- Setaria italica v2.2
- Sisymbrium irio v1.0
- Solanum chacoense v4.1
- Solanum lycopersicum ITAG2.4
- Solanum melongena v2.5.1
- Solanum pennellii acc.LA0716. v2.0
- Solanum tuberosum v4.03
- Sorghum bicolor v3.1.1
- Spinacia oleracea v1.0
- Spirodela polyrhiza v3.0
- Symbiodinium minutum v1.0
-- T --
- Thellungiella parvula v2.0
- Theobroma cacao v2.0
- Trifolium pratense v2.1
- Trifolium subterranum v1.1
- Triticum aestivum TGACv1
- Triticum turgidum v1.0
- Triticum urartu ASM34745v1
-- U --
- Ulva mutabilis WT 1
- Utricularia gibba v4.1
-- V --
- Vigna subterranea v1.0
- Vitis vinifera v2.1
- Volvox carteri v2.1
-- W --
-- X --
-- Y --
-- Z --
- Zea mays ssp mays v5.0
- Zostera marina v2.0
- Zoysia japonica v1.1
- Zoysia matrella v1.0
- Zoysia pacifica v1.0